Os estudos da ictiofauna na área de influência de Itaipu tiveram início em 1977, cinco anos antes da formação do reservatório. A iniciativa envolveu universidades, institutos de pesquisa e entidades governamentais. Desde então, 221 espécies de peixes já foram identificadas no rio Paraná e seus afluentes entre Foz do Iguaçu e Guaíra, dando início a uma série de projetos para compreender a ecologia e possibilitar o manejo deste componente fundamental da biodiversidade neotropical.
Estudos de marcação e recaptura, mantidos desde 1997 em parceria com várias entidades, revelaram que ao menos 20 espécies de peixes ocupam extensas áreas para completar seu ciclo de vida, e são capazes de migrar centenas de quilômetros em busca de áreas apropriadas para a reprodução; é o caso de espécies emblemáticas da região e fundamentais para a pesca, como o dourado (Salminus brasiliensis), o pintado (Pseudoplatystoma corruscans), a curimba (Prochilodus lineatus), o pacu (Piaractus mesopotamicus) e a piapara (Leporinus elongatus).
Em 31 anos de pesquisas, mais de 51 mil peixes receberam implantes de marcas externas com numeração individual, o que permite apurar seus dados de deslocamento e determinar suas áreas de vida e suas necessidades em termos de habitat, em cada fase de seu desenvolvimento. Tal comportamento revelou a necessidade de manter a conectividade do curso principal do rio Paraná, motivando a criação do Canal da Piracema
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